Selekcja dysruptywna ma miejsce, gdy faworyzowane są fenotypy skrajne na korzyść form pośrednich. Zazwyczaj dzieje się tak, gdy zmiany środowiskowe tworzą warunki, w których dwa odrębnce cechy dają przewagę w przetrwaniu.
Wyobraźmy sobie populację królików o brązowej sierści, maskujących ich w lesie. Jeśli las zostanie wycięty i zastąpiony otwartymi polami z rozproszonymi drzewami, brązowa sierść przestanie dawać efektywne maskowanie. Króliki z bardzo jasną sierścią mogłyby się maskować w trawie, a te z bardzo ciemną – wśród drzew. Króliki z pośrednim kolorem wyróżniałyby się dla drapieżników i częściej by ginęły.
Z czasem częstość jasno- i ciemnoskórych królików wzrosłaby, a pośrednich spadłaby. Ta zmiana to klasyczny przykład selekcji dysruptywnej.