Naukowcy nie w pełni rozumieją, jak zwierzęta wiedzą, gdy trąba powietrzna się zbliża, ale istnieje kilka teorii. Jedną z możliwości jest to, że zwierzęta wykrywają zmiany ciśnienia atmosferycznego występujące przed formowaniem trąby. Inna to, że czują zakłócenia elektryczne związane z piorunami i aktivnością burzową. Na koniec, zwierzęta mogą po prostu widzieć lub słyszeć wizualne i dźwiękowe znaki, takie jak ciemne obracające się chmury lub głośny ryk wiatru.
Reakcje zwierząt różnią się w zależności od gatunku, wielkości i lokalizacji. Psy i koty mogą stać się niespokojne, chodzić nerwowo, głośno szczekać lub chować się pod meblami. Zwierzęta hodowlane, takie jak krowy, konie i świnie, mogą stać się podrażnione i próbować uciec z zagrody lub szukać schronienia w stodołach. Dzika fauna, jak jelenie, króliki i ptaki, mogą uciekać do lasów lub innego krycia, lub wspinać się na wyższą grondę, by uniknąć powodzi.
Nie wszystkie zwierzęta reagują tak samo. Właściciele zwierząt w rejonach narażonych na trąby powietrzne powinni znać znaki ostrzegawcze i zapewnić swoim zwierzętom bezpieczne miejsce do schronienia.