Kojoty niezwykle adaptacyjne, żyją w szerokim wachlarzu ekosystemów, najczęściej:
- Łąki i stepy: Tradycyjne siedlisko z otwartymi przestrzeniami do polowania.
- Lasy: Lasy iglaste i liściaste dające krycie i pożywienie.
- Pustynie: Środowiska suche, gdzie znajdują wodę i polują.
- Obszary podmiejskie i miejskie: Coraz częściej blisko ludzi z powodu dostępności pożywienia.
W skrócie: kojoty radzą sobie w większości siedlisk z wystarczającą ilością pożywienia i krycia.