W ekosystemie jeziora żywe (biotyczne) i nieżywe (abiotyczne) elementy wchodzą w złożone interakcje:
Obieg składników: Fitoplankton i mikroby używają światła i składników (azot, fosfor) do tworzenia materii organicznej.
Rozkład i tlen: Bakterie i grzyby rozkładają martwą materię, uwalniając składniki; poziom tlenu wpływa na wydajność rozkładu.
Temperatura i warstwowatość: Ogrzewanie słońcem tworzy warstwy termiczne, wpływające na to, gdzie organizmy żyją i szukają zasobów.
pH i alkalicność: Chemia wody, ukształtowana geologią i biologią, decyduje, jakie gatunki przetrwają.
Drapieżnictwo i konkurencja: Interakcje gatunków kontrolują liczebności i kształtują społeczność.
Wpływ człowieka: Zanieczyszczenia i gatunki obce wprowadzone przez ludzi zakłócają składniki, tlen, równowagę.
Zmiana w jednym elemencie może kaskadowo wpłynąć na cały system jeziora.