Rekiny wielorybowe występują w ciepłych wodach tropikalnych i subtropicalnych na całym świecie, preferując temperatury między 21°C a 30°C (70°F–86°F).
Regiony:
Zachodni Ocean Indyjski (Seszele, Malediwy, Tanzania), Zatoka Meksykańska, Filipiny, Zachodnia Australia (Rafa Ningaloo), Wyspy Galapagos, Morze Czerwone.
Są to gatunki wędrowne, więc ich lokalizacje zmieniają się sezonowo. Skonsultuj się z lokalnymi przewodnikami, aby dowiedzieć się najlepszych terminów na obserwację.