Polowanie
Przez ponad 150 lat wydry morskie były polowane na cenne futro. Na początku 1900 r. zostało tylko kilka set w izolowanych enklawach.
Utrata siedliska
Wydry morskie zależą od lasów morszczukowych jako pożywienia i schronienia. Lasy morszczukowe znikają przez zanieczyszczenia, zmiany klimatu i przeżeranie przez jeżowice morskie.
Zanieczyszczenia
Wycieki ropy, ścieki i inne zanieczyszczenia trują wodę i pożywienie, powodując choroby i śmierć. Zanieczyszczenia też niszczą lasy morszczukowe.
Drapieżnictwo
Reki, orki i orły łuskie okazjonalnie polują na wydry morskie, ale zazwyczaj nie stanowią istotnego zagrożenia.
Choroby
Wydry morskie są podatne na choroby bakteryjne, wirusowe i pasożytnicze, które mogą być śmiertelne, zwłaszcza dla młodych.
Zmiany klimatyczne
Rosnące temperatury oceanów powodują spadek lasów morszczukowych. Topnienie lodów zmniejsza siedlisko i zwiększa wrażliwość na burze.