Kwokka stoją przed wieloma zagrożeniami, które przyczyniły się do ich statusu zagrożonego:
Drapieżnictwo przez gatunki wprowadzone: Koty i lisy, nie rodem z wyspy Rottnest, polują na kwokki.
Utrata i fragmentacja siedliska: Wyrębanie pod rolnictwo, rozwój i górnictwo niszczy i dzieli siedlisko kwokk, limitując ruch i dostęp do pożywienia i schronienia.
Choroby: Kwokka są wrażliwe na choroby i pasożytów, w tym wirusy przenoszone przez kleszcze i infekcje dróg oddechowych.
Interakcje z ludźmi: Karmię kwokki ludzkim pożywieniem może powodować problemy zdrowotne i zmieniać naturalne zachowania.
Ograniczona różnorodność genetyczna: Niska różnorodność genetyczna na wyspie Rottnest czyni kwokki bardziej podatnymi na choroby i zmiany środowiska.
Zmiany klimatu: Wzrost poziomu mórz i zmienne opady mogą dalsze zagrażać ich siedlisku i przetrwaniom.