Lamantyny żyją zarówno w strefie fotycznej, jak i afotycznej. Strefa fotyczna to górna warstwa oceanu dostatecznie nasłoneczniona do fotosyntezy, a afotyczna nie otrzymuje wystarczająco światła.
Zamieszkujące wody przybrzeżne i rzeki lamantyny potrafią nurkować do głębokości ok. 9 m (30 stóp). Choć mogą przebywać w strefie fotycznej, nie są do niej ograniczone i występują też w głębszych, afotycznych wodach.