Phycoerythrin wydaje się czerwony, ponieważ pochłania światło głównie w niebiesko-zielonym regionie widma (osiągając około 495 nm długości fali) i odbija czerwone światło. Ten pigment odgrywa rolę w fotosyntezie poprzez skuteczne przechwytywanie energii światła z niebiesko-zielonej części spektrum i przenosząc ją do chlorofilu A, głównego pigmentu fotosyntetycznego. Maksymalizując wchłanianie światła, fikoerytryna pozwala na efektywne fotosyntetyzowanie glonów w głębokiej wodzie lub zacienionym środowisku, w których niebiesko-zielone światło przenika dość dobrze.
Wraz z fikoerytryną inne fikobiliproteiny, takie jak fikocyjanina (pojawiająca się niebieska) i alloficyanina (wyglądająca na niebiesko-zieloną), również przyczyniają się do żywych kolorów obserwowanych u różnych gatunków alg.