Główni naturalni drapieżnicy rekinia łososiowego (Lamna ditropis) to:
1. Większe rekiny: Większe gatunki rekinów, np. rekin białorybi, polują na rekinie łososiowe, zwłaszcza młode i mniejsze osobniki.
2. Orki (koszatnice): Orki to drapieżniki wierzchołkowe i oportunistyczni polujący, którzy wliczają rekinie łososiowe do swojej diety, szczególnie tam, gdzie zasięgi się nakładają.
3. Ssaki morskie: Niektóre ssaki morskie, jak foki i lwy morskie, były zaobserwowane przy zabijaniu i zjadań rekinów łososiowych.
4. Połowstwo ludzkie: Połowstwo komercyjne i rekreacyjne może mieć istotny wpływ na populacje rekinia łososiowego przez celowane połowy, przyboczne złowy i połowy sportowe.
Mimo istnienia drapieżników, rekinie łososiowe wciąż uważane są za drapieżników wierzchołkowych ze względu na ich pozycję na szczycie łańcucha pokarmowego w wielu ekosystemach morskich.