Massachusetts to stosunkowo mały stan, ale ma wielkie obszary naturalnego siedliska wspierające liczne gatunki roślin i zwierząt. 31 gatunków zwierząt zagrożonych wyginięciem, 15 zagrożonych. Często wpływy zmian środowiskowych i siedlisk, czasem polowanie zdziesiątkuje liczby.
Ptaki i ssaki
12 gatunków ptaków zagrożonych, 6 zagrożonych. Zagrożone: orzeł łysy, sokół wędrowny, bittern amerykański, kulik łąkowy, sowa krótkaucha. Zagrożone: sowa długoucha, kaczka krolewska, jastrząb pogorzelski, wróbel wieczorny. Tylko jeden ssak lądowy zagrożony: nietoperz Indiana (Myotis sodalis) – zatonienie nor jaskiniowych i ingerencja ludzie drastyczny spadek populacji.
Ryby
4 gatunki ryb zagrożonych, dwie żyją w oceanie, lęgują w rzekach stanu. Krótkonosy i atlantycki jeżor – lęgują w rzekach, wpływ tamy. Dwa inne: łebka jeziorna i krasnobrzuchy krasnolotek – zanieczyszczenie i przekierowanie strumieni na rolnictwo. Lampretka amerykańska i trójkolowy kolczug – zagrożone.
Gady i płazy
Dwa żółwie zagrożone: błotnisty i północny czerwonobrzuchy. Błotnisty żółw i diamentowy żółw – zagrożone. Trzy węże zagrożone, dwa jadowite. Miedzianka i wąż dętkowy lasowy – zagrożone, niejadliwy wąż szczypiornik wschodni. Wąż robak wschodni – zagrożony. Większość płazów stan bezpieczna, poza salamandrą marmurową i ropuchą łopatkowatą wschodnią – zagrożone.
Gatunki oceaniczne
Choć nie stałe mieszkańcy, 9 gatunków oceanicznych chronionych prawem i wpisanych jako zagrożone. Sześć wielorybów wędrujących wodami przybrzeżnymi: kaszlot, finwal, seiwal, niebiański, grzbietowy, północny. Trzy żółwie morskie: kareta, żółw Kempsa, żółw skórzany. Żółw kareta i zielony morski – zagrożone w wodach przybrzeżnych.