Mało naturalnych wrogów
Wieloryby szare są masywne i silne, z kilkoma naturalnymi zagrożeniami. Orki mogą okazjonalnie atakować młode lub osłabione dorosłe, a rekiny białe były zaobserwowane atakujące młode.
Największe zagrożenie
Działalność człowieka, w tym utrata siedlisk, zanieczyszczenia i zapadanie w sieci rybackie, stanowi najpoważniejsze niebezpieczeństwo dla wielorybów szarych.