Skamienienie, czyli mineryzacja, to proces, w którym materiał organiczny z czasem jest zastępowany przez minerały. Gdy minerały całkowicie zastępują tkanki organizmu, mówi się o powszechnej mineryzacji lub całkowitym skamienieniu.
W tym procesie woda gruntowa bogata w minerały przysika do szczątków i stopniowo zastępuje materiał organiczny – w tym struktury wewnętrzne i szczegóły mikroskopowe – minerałami takimi jak krzemionka, kalcyt lub pyryt. Efektem jest kamienny replikant zachowujący oryginalny kształt i skomplikowane detale.
Przykłady to skamieniałe kości, muszle, drewno i liście, które dostarczają cennych informacji o starożytnym życiu i warunkach skamieniałości.